Οι πρωτείνες που δεσμεύονται στον υποκινητή του γονιδίου και πάνω σε αυτούς οι RNA πολυμεράση. Έται μπορεί να ξεκινήσει η μεταγραφή του γονιδίου. Τις περισσότερες φορές κάποιοι μεταγραφικοί παράγοντες δεσμεύονται πάνω στη πολυμεράση και κάποιοι άλλοι στον υποκινητοί. Έτσι όταν τα πρωτεινικά μόρια ενωθούν, επιτυγχάνεται και η δέσμευση της RNA πολυμεράσης στον υποκινητή.